2015年，深圳市宝安区率先提出建设“中医药创新之都”，推进中医医疗、科教、文化交流与传播、产业、大数据5个中心建设，为深圳市2016年成功创建国家中医药综合改革试验区提供宝贵经验。2018年，宝安区委区政府为落实十九大报告“中西医并重，传承发展中医药事业”的要求，提出首创我国最专业纯中医治疗医院的构想，为创新中医诊疗模式提供强力支撑，发挥中医药在治未病中的主导作用、在重大疾病治疗中的协同作用、在疾病康复中的核心作用以及中医药“简、便、效、廉”优势，解决群众看病难、看病贵问题。
　　 　　2018年11月23日，深圳市宝安区委书记姚任同志率队赴北京向国家中医药管理主管部门领导专家专题汇报了医院建设情况。会上，国家中医药管理主管部门对我区建设纯中医治疗医院表示高度肯定与明确支持，认为宝安区将中医药事业发展列入“一把手工程”是践行习总书记“继承好、发展好、利用好”中医药传承创新发展的实际行动，值得全国学习。指示该院定性为研究型中医院，并提议与中国中医科学院建立紧密型合作关系，共同推进科研、医疗、教学等方面的合作；同时要求医院建成粤港澳大湾区核心中医院，为香港、澳门中医院建设提供基础及人才支撑，成为践行习总书记“中医药走向世界”的实践基地。2018年12月14日，深圳市宝安区人民政府副区长周学良同志率队赴北京向中国中医科学院领导、专家专题汇报国家中医药管理主管部门余艳红书记有关指示，落实宝安纯中医治疗医院与中国中医科学院建立紧密型合作关系，共同推进科研、医疗、教学等方面的具体合作意向。
　　 　　医院定义：以中医理论为指导，运用中医辨证思维和中医临床路径，单纯采用中药和针灸、康复、推拿等中医经典疗法开展中医优势病种，“治未病”、疑难杂症治疗和康复为主要特色的医疗机构。办院宗旨：荟萃我国中医药精华，以高度的文化自信推动纯中医药诊疗技术振兴发展，打造中国最专业的纯中医医院。建设模式：医院采取“大门诊、小住院”模式，规划建设200张病床的三级纯中医治疗医院。科室设置：（一）门诊科室。门诊主要设置中医基础科门诊、治未病中心、针灸推拿康复科、国医大师工作室、流派大师工作室、传承医师工作室；在中医基础科门诊下设10个科室，包括内科、妇科、儿科、皮肤科、肛肠科、正骨门诊（其中内科包括心病科、肝病科、脾胃病科、肺病科、肾病科门诊）。（二）住院科室。开设4个住院部，分别是内科、妇科、针灸推拿康复科、杂病科。（三）中医特色项目。包括中医药科学研究中心、中医药博物馆、中医药体验馆、中医药国际教育培训学院，重点打造国际化的中医药文化传播交流中心。